海域自然环境概括调查的主要内容有：地理位置；地质地貌特征及沉积物类型；气象特征，如气温、风向和风速、降水量及其空间分布等；水温特征，以及潮位、潮流、波浪等；海洋自然资源调查，如渔业资源、油气资源、矿产资源和景观资源等。
沿岸社会环境概况调查，包括：城镇的规模、性质、行政区划及人口；社会经济状况；城市总体发展规划；海域功能区划；环境保护目标等。
污染源调查内容包括：
(1)人海点源。人海点源包括：人海河流、混合排放口、直排口和市政下水排海口等。调查人海点源位置、人海水量、污染物的种类和数量等。
(2)面污染源。乡镇农村的工业废水、生活污水、农田化肥、农药、生长剂等随地表径流的污染物人海量。
(3)养殖污染源。滩涂养殖、浅海养殖、网箱养鱼的过剩饵料、排泄物、碎屑等污染物人海量。
(4)海上污染源。海上船舶、石油平台、海洋倾废等产生的污染物入海量。
海洋生物调查的目的在于通过对海洋生物的调查，了解调查海区敏感类、关键类及经济类生物，海洋生态环境现状及其变化情况，从而为建立生态学模型和预测污染物人海后对海洋环境可能产生的影响程度和范围提供基础数据。调查方法首先应收集已有调查资料，经过筛选充分利用。若现有资料不足时，可根据评价工作等级并按评价大纲审定的项目进行补充实测。
