海洋生态调查按《海洋调查规范》(GB/T127633.9--2007)中“海洋生态调查指南”执行。包括海洋生态要素调查和海洋生态评价两部分。海洋生态要素调查包括：
1.海洋生物要素调查。⑴海洋生物群落结构要素调查。①微生物、叶绿素a、游泳动物、底栖生物、潮间带生物和污损生物调查。②浮游植物调查。③浮游动物调查。⑵海洋生态系统功能要素调查。着重调查初级生产力、新生产力和细菌生产力。
2.海洋环境要素调查。⑴海洋水文环境要素调查。⑵海洋气象要素调查。⑶海洋光学要素调查。⑷海水化学要素调查。⑸海洋底质要素调查。
3.人类活动要素调查。⑴海水养殖生产要素调查。⑵海洋捕捞生产要素调查。⑶入海污染要素调查。⑷海上油田生产要素调查。⑸其他人类活动要素调查。
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